Здравствуйте, Сергей!
Непонятно, сознательно ли Вы путаете понятия свободы вероисповедания и отделения государства от Церкви. Если первое, действительно, закреплено в Конституции, то второго в законе нет. Подробнее об этом читайте статью на нашем сайте. Истоки этого смешения коренятся в Конституции СССР. Но даже там не все так однозначно. Об этом читайте материал по ссылке.
В первой статье Вы найдете информацию как преподавание религиозных дисциплин вполне коррелирует с правами граждан таких государств как Германия, Британия и, даже, Франция. Программа основ религиозных культур и светской этики в нашей стране включает в себя шесть курсов, только один из которых основан на Православии. Остальные носят светский характер или описывают культуру других религий. Как атеист Вы можете избрать курс светской этики. Есть еще одна подмена, которую Вы совершаете, отождествляя светскость и атеизм. А это разные понятия. Об этом читайте здесь.
Приравнивание светскости к атеизму, а научности к материализму – наследие советского идеологизированного научного творчества. Вы достаточно молоды, чтобы преодолеть эту идейную аберрацию.