Здравствуйте, Ольга!
С древних времен в христианских храмах существовала традиция раздельного пребывания мужчин и женщин в храме во время молитв. Известное, например, в каждом храме место для верхнего хора раньше было местом пребывания именно женщин. Хор же располагался на клиросах. Это было сделано для того, чтобы внимание христиан было больше сосредоточено на молитве, а не на представителях (или представительницах) противоположного пола. Если женщина приходит с маленьким сыном, ему вполне можно пребывать вместе с матерью.